宇宙世紀0087年，地球圈陷入了極度的戰亂時代。在這場聯邦軍菁英組織「迪坦斯」與反地球聯邦組織「幽谷」之內戰進行的同時，幽谷改由克瓦特羅（夏亞）全權指揮，「從木星回來的男人」希羅克企圖將迪坦斯納為己有，而吉翁軍殘存勢力「阿克西斯」的指導者哈曼‧坎恩則誓言復興「薩比家」。這三股勢力為了爭奪地球圈的霸權，在複雜的政治與軍事策略之情勢中，作戰舞台移至被改造為巨大雷射砲的宇宙殖民地「格里布斯2」，進入最終的局面。 人們的愛情與憎恨在戰場上互相交錯，蕾柯亞離開了幽谷，加入迪坦斯的希羅克陣營；少女莎拉雖然非常喜愛希羅克，但她也漸漸對幽谷的卡密兒等人產生興趣。眾人各自懷著不同的想法，而Z鋼彈也在這樣的氛圍中朝著混亂的戰場飛去。 後來卡密兒終於知道，Z鋼彈所擁有的力量究竟是為了打倒誰而存在。在這場漫長的戰爭中，卡密兒最後會有什麼樣的命運呢？